Le parti sopravvissute dell’antico edificio trecentesco sono costituite prevalentemente dalla facciata rivestita da pietre squadrate e regolari e dalla parte bassa del lato destro, fino alla cornice marcapiano.

L’articolato portale d’ingresso principale è caratterizzato da briose decorazioni nell’archivolto, negli stipiti a fasci di colonne e nei capitelli a fogliame ricurvo. Al fianco sinistro della chiesa sono addossati l’elegante chiostro a due ordini e gli annessi monastici, adibiti oggi a sede del comune.

L’interno del tempio, a navata unica rettangolare, presenta uno stile tipicamente barocco con sfarzosi elementi che valorizzano gli spazi.

Accostati ai muri adiacenti all’ingresso, vi sono due confessionali lignei scolpiti risalenti al XVIII sec. Nella controfacciata vi è una lunga iscrizione in latino che ricorda gli avvenimenti storici che hanno interessato la chiesa, posta sotto lo stemma francescano

L'aula è divisa dal coro mediante una struttura di muratura a stucco, davanti alla quale è situato l'altare maggiore. In una teca di vetro al di là del divisorio sono custodite le reliquie di San Nicola Greco che ogni 25 anni lasciano la chiesa in occasione di una solenne processione per le vie della città.

Dall’interno della sagrestia è possibile scendere nei locali sotterranei della chiesa, in cui giacciono elementi architettonici e scultorei in pietra, basi, capitelli, pezzi di colonne, alcuni anche con tracce di policromia, e rilievi scolpiti.